Publication:
Search for Tandem Repeats in the First Chromosome from the Rice Genome

Дата
2020
Авторы
Kamionskaya, A. M.
Korotkov, E. V.
Korotkova, M. A.
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Издатель
Научные группы
Организационные подразделения
OrgUnit Logo
Организационная единица
Институт лазерных и плазменных технологий
Стратегическая цель Института ЛаПлаз – стать ведущей научной школой и ядром развития инноваций по лазерным, плазменным, радиационным и ускорительным технологиям, с уникальными образовательными программами, востребованными на российском и мировом рынке образовательных услуг.
OrgUnit Logo
Организационная единица
Институт интеллектуальных кибернетических систем
Цель ИИКС и стратегия развития - это подготовка кадров, способных противостоять современным угрозам и вызовам, обладающих знаниями и компетенциями в области кибернетики, информационной и финансовой безопасности для решения задач разработки базового программного обеспечения, повышения защищенности критически важных информационных систем и противодействия отмыванию денег, полученных преступным путем, и финансированию терроризма.
Выпуск журнала
Аннотация
© 2020, Springer Nature Switzerland AG.Using the RPWM method, we searched for tandem repeats of 2 to 50 nucleotides long in the rice genome. We compared the effectiveness of the RPWM method with Mreps, T-reks, Tandem Repeat Finder and ATR Hunter. About 70% of the tandem repeats found could not be found by other algorithms. The correlation of dispersed repeats and transposons with tandem repeats was studied in this work. We assumed that some of the dispersed repeats and transposons originated from tandem repeats
Описание
Ключевые слова
Цитирование
Kamionskaya, A. M. Search for Tandem Repeats in the First Chromosome from the Rice Genome / Kamionskaya, A.M., Korotkov, E.V., Korotkova, M.A. // Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics). - 2020. - 12304 LNBI. - P. 291-295. - 10.1007/978-3-030-57821-3_26
URI
https://www.doi.org/10.1007/978-3-030-57821-3_26
 https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85090096556&origin=resultslist
 https://openrepository.mephi.ru/handle/123456789/22292
Коллекции
Публикации