Publication:
ОБНАРУЖЕНИЕ ДИСПЕРСНЫХ ПОВТОРОВ В РАСТИТЕЛЬНЫХ ГЕНОМАХ С ПОМОЩЬЮ IP МЕТОДА

Дата
2025
Авторы
РУДЕНКО, В. М.
КОРОТКОВ, Е. В.
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Издатель
НИЯУ МИФИ
Научные группы
Организационные подразделения
Организационная единица
Институт лазерных и плазменных технологий
Стратегическая цель Института ЛаПлаз – стать ведущей научной школой и ядром развития инноваций по лазерным, плазменным, радиационным и ускорительным технологиям, с уникальными образовательными программами, востребованными на российском и мировом рынке образовательных услуг.
Выпуск журнала
Аннотация
Метод IP было применен нами для поиска дисперсных повторов (ДП) в геноме риса. Было сгенерировано 79 семейств повторов; общее число ДП в них составило 992,739. Проводилось исследование местоположения ДП в геноме, и было показано, что они в основном локализованы в некодирующих областях. Полученные данные сравнивались с ДП риса, детектированными ранее программным конвейером EDTA. Отмечается, что IP метод обнаруживает гораздо большее число сильноразмытых ДП средней длины, чем существующие математические подходы.
Описание
Ключевые слова
Цитирование
Руденко В. М. ОБНАРУЖЕНИЕ ДИСПЕРСНЫХ ПОВТОРОВ В РАСТИТЕЛЬНЫХ ГЕНОМАХ С ПОМОЩЬЮ IP МЕТОДА / Руденко В. М., Коротков Е. В. // Лазерные, плазменные исследования и технологии - ЛаПлаз-2025: сборник научных трудов XI Международной конференции. - 2025. - С. 121